目前不允許使用生物質鍋爐的地區極少，深圳等地確實明令禁止該類設備的使用，但是取締的原因并不是因為鍋爐本身的問題。生物質鍋爐并非高污染型鍋爐，但是不少鍋爐用者會在運行生物質成型燃料鍋爐時使用非成型燃料或摻燒煤類，使得鍋爐設備無法達到鍋爐排放標準。實際上，若采用壓塊、顆粒等生物質燃料，生物質鍋爐的環保性能是肯定會達標的，只是對于個別城市來說，鍋爐管制較為復雜，因此直接采取了禁止使用的措施。需要說明的是，國家鼓勵生物質能的發展，尤其是北方地區及生物質豐富的省市，甚至出臺了的具體的生物質鍋爐排放標準，因為該類鍋爐是符合可持續發展戰略的。